Steeds meer tweede kamer partijen zien een centrale opslag van vingerafdrukken niet zitten. Daarnaast is het agentschap welke de vingerafdrukken zou regelen in diskrediet geraakt. Dit is gebleken uit een overleg over de biometrische gegevens.
Tijdens dit overleg kwam naar boven water dat het Agentschap Basisadministratie Persoonsgegevens en Reisdocumenten (BPR) twee onderzoekers van het Nederlandse Rijk en TNO de toegang niet had verschaft omdat zij de kritisch zouden zijn over de toepasbaarheid van het plan. Vele gemeenten hebben laten weten dat zij afzien van centrale opslag.
De Raadsleden van verscheidene gemeenten vinden de opslag in een database een inbreuk op de privacy van de burgers. Ook politici twijfelen over het nut en zijn bang dat de beveiliging van de gegevens moeilijk gaat worden.